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La corrélation en microscopie : de l’analyse de co-localisation à la fusion d’images

Cette formation est organisée à l’initiative du Réseau Technologique MFM et de la plateforme PICT-IBISA UMR144 Institut Curie/CNRS, avec le soutien de la Mission pour l’Interdisciplinarité du CNRS et de la formation permanente de l’Inserm et de la DR3 du CNRS.

Coordinatrice : Perrine Paul-Gilloteaux (perrine.paul-gilloteaux chez curie.fr)

Fiche d’inscription

Contacts :

CNRS – Délégation Ile-de-France Est – Pôle Formation – Tour Europa 126 – 94532 Thiais Cedex Tél. : 01 56 70 76 00 – Fax : 01 56 70 51 20 formation chez iledefrance-est.cnrs.fr

Date limite d’inscription : 11 juillet 2014

Objectifs

- Savoir interpréter le calcul de corrélation (spatiale ou temporelle), et connaître les différentes façons de calculer un coefficient de corrélation
- Comprendre les méthodes associées, telle que l’optimisation numérique.
- Connaitre et savoir utiliser des logiciels basées sur cette notion pour la colocalisation, la détection d’objet biologiques, l’analyse de dynamique, le mosaiquage ou encore le recalage d’image.
- Connaitre des alternatives à la corrélation
- Essaimer les approches technologiques et méthodologiques au sein des laboratoires au travers des participants.
- Echanger sur les différentes approches méthodologiques utilisant la corrélation.

Intervenants

Perrine Paul-Gilloteaux PICT Institut Curie CNRS François Waharte PICT Institut Curie CNRS Thibault Lagache Unité d’Analyse d’Images Biologiques Institut Pasteur CNRS

Programme

Jeudi 11 septembre 2014 10h-10h15 Accueil des participants/ café 10h15-10h30 tour de table des participants 10h30-11h30 Introduction formation et présentation des outils logiciels utilisés pendant la formation. 11h30-12h30 Définition de la corrélation : cadre théorique et champs d’applications 12h30-13h30 Repas 13h30-16h00 La colocalisation en microscopie photonique basée correlation et approches basées sur l’analyse spatiale ponctuelle (cours et session pratique) 16h00 -16h15 pause 16h15 - 18h30 Spectroscopie par corrélation d’image (ICS TICS RICS) 19H30 - dîner

Vendredi 12 septembre 2014 8h30-10h La corrélation comme mesure de similarité : notion de domaine de transformation et d’optimisation numérique 10h-10h15 Pause café 10h15-12h15 Session pratique : application à la recherche de motifs (détection de structure ou d’évènement) 12h15-13h15 Repas 13h15-15h15 Session pratique : application au recalage d’images et mosaïquage (fusion de données) 15h15-15h30 Pause café 15h30- 16h30 Session pratique : application aux calculs de carte de flux 16h30-17h00 Retour d’expérience sur les projets des participants 17h-17h30 Discussion/évaluation